Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms