Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl2Q3UMU9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl2Q3UMU9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl2Q3UMU9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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