Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms