Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nom1Q3UFM5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nom1Q3UFM5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms