Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms