Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms