Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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