Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms