Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms