Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Otud5Q3U2S4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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