Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Kdm4dQ3U2K5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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