Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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