Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms