Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms