Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RubcnlQ3TD16 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms