Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms