Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defb33Q30KN3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb33Q30KN3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms