Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms