Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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