Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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ptchd1Q14B62 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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ptchd1Q14B62 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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ptchd1Q14B62 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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ptchd1Q14B62 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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ptchd1Q14B62 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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