Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms