Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms