Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms