Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms