Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms