Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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