Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms