Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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