Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms