Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GscQ02591 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms