Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms