Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SeleQ00690 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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