Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms