Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms