Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms