Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irx2P81066 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Irx2P81066 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms