Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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