Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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