Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23aP62751 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms