Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpfP62307 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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