Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2kP61087 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms