Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppfia3P60469 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms