Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CgnP59242 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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