Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms