Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp25P57080 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms