Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms