Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms