Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TspoP50637 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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