Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms