Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms